2003年波尔图的欧冠轰动了整个欧州足坛。穆里尼奥的教练之才无法埋藏于葡超联赛，俄罗斯寡头阿布收购下的切尔西。晃了晃笔，嗨！小穆来吧，建立你的王朝！
2004年7月，穆里尼奥正式出任切尔西一线队主教练。 夏窗，穆里尼奥带来了在波尔图的爱将里卡多·卡瓦略、保罗·费雷拉，又利用俱乐部老板罗曼·阿布拉莫维奇的巨额投入引进迪迪埃·德罗巴、彼得·切赫、阿尔扬·罗本等强援。 2004-05赛季，穆里尼奥为切尔西制定了一套4-3-3阵形，依靠中后场的不断逼抢，为前场制造进攻机会，并加快了攻防转换的节奏。 英超首轮，切尔西在主场1-0战胜曼联，此后穆里尼奥率领球队拿到了6胜2平的开局。虽然球队当时在积分榜上仍落后于阿森纳，但在主场战胜埃弗顿之后，穆里尼奥的球队就牢牢占据了积分榜的头名位置。38轮战罢，穆里尼奥率队以29胜8平1负积95分及全赛季只失15球的战绩刷新了英格兰顶级联赛的积分纪录及失球最少纪录，成功打破不可一世统治多年的曼联，长时间垄断英超冠军的局面，夺得球队阔别50年的英格兰顶级联赛冠军，捧起了切尔西队史上的第一座英超冠军奖杯。那个时代切尔西边路一左一右罗本和达夫的组合犀利无比，他们有着相同的特点，相似的踢球方式，这对边路魔翼的默契很有后来罗贝里的风采。在比赛中，罗本用魔幻般的脚步连过数人内切，和兰帕德多次完成了这记不可思议的双人射门。穆里尼奥曾称赞罗本说，他是我见过的带球速度最快的球员。穆里尼奥也成为首个在英超的处子赛季就率队夺冠的主教练。 同时当赛季的英联杯中，切尔西一路闯入决赛并在决赛中3-2击败利物浦，夺得冠军。 在欧洲赛场上，穆里尼奥率队相继淘汰巴萨和拜仁，但在半决赛中0-1不敌利物浦，无缘欧冠决赛。
2005-06赛季初，穆里尼奥率队在英格兰社区盾杯决赛中以2-1的比分击败阿森纳夺得冠军。 在英超联赛中，穆里尼奥的切尔西以摧枯拉朽之势实现开局九连胜。随后球队状态下滑，先是1-1战平此前七场不胜的埃弗顿结束连胜，在英联杯中被弱旅查尔顿淘汰出局，在欧冠小组赛中败给皇家贝蒂斯，在老特拉福德终结了英超联赛连续40场不败的纪录。但即便这样，切尔西仍领先曼联10个积分。在卸下包袱后，穆里尼奥的球队高歌猛进，实现英超10连胜。2006年1月中旬，切尔西已经领先第二名曼联16分，领先少赛两场暂居第三的利物浦17分，夺冠已是时间问题。虽然此后分别在客场被米德尔斯堡与富勒姆击败，但优势巨大的切尔西还是早早卫冕了英超冠军。然而在欧洲赛场上，穆里尼奥的球队于欧冠1/8决赛便被巴萨淘汰出局，止步欧冠16强。
2006年夏窗，阿布为切尔西买下安德烈·舍甫琴科和米夏埃尔·巴拉克，穆里尼奥因这两名球员的加盟而改变了原先已经得心应手的阵形。赛季初，切赫、乔·科尔、克劳德·马克莱莱等主力的受伤也为这个赛季蒙上了一层阴影。在节礼日与1月赛程中，切尔西在负于利物浦后连续被雷丁、富勒姆和维拉逼平，此时曼联对切尔西的领先优势达到了6分。冬窗，意识到球队出现后防危机的穆里尼奥要求俱乐部引进后卫，阿布却置若罔闻。此后的争冠冲刺期，切尔西在九连胜之后再度陷入连平怪圈，最终英超冠军被曼联夺得。该赛季，虽然球队无缘英超冠军，但穆里尼奥率队拿到了足总杯与英联杯两项冠军。
2007年夏窗，穆里尼奥和阿布在夏季转会窗口上的剑拔弩张让双方的分手进入了倒计时：在转会市场上，俱乐部仅免签克劳迪奥·皮萨罗、塔尔·本·哈伊姆，400万镑买进儒利亚诺·贝莱蒂，1600万镑买入弗洛伦特·马卢达。切尔西在转会市场上有了盈利，但对穆里尼奥来说难以接受。在社区盾决赛中点球负于曼联之后，球队在英超开局6轮比赛中取得3胜2平1负的战绩位列积分榜第五，此时穆里尼奥下课的传闻已经越来越多。欧冠小组赛首轮，穆里尼奥的切尔西被罗森博格1-1逼平，这成为了穆里尼奥下课的导火索。一天后，俱乐部宣布穆里尼奥下课。
第一次执教切尔西期间，穆里尼奥率队夺得2座英超冠军、1座足总杯冠军、2座英联杯冠军和1座社区盾冠军。
一期切尔西在穆帅的打造下充满了激情，速度。也成就了“特殊的一个”
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